结肠癌肠道菌群测序的初步研究
肠道微生物群由生活在我们肠道中的微生物组成,可以为我们提供有关健康的信息,因为它的组成可能取决于饮食、生活方式或我们的病理等因素。此外,了解我们肠道中的特定细菌有助于预测结肠癌等疾病。基因组测序方法的新进展,以及使我们能够分析数据的生物信息学工具,帮助我们通过基因组分析识别出存在于我们肠道中的数千种新微生物。
来自 Bellvitge 生物医学研究所 (IDIBELL) 和加泰罗尼亚肿瘤研究所 (ICO) 的一组研究人员对肠道微生物群基因组进行了初步测试。在这项研究中,他们通过两种不同的测序方法分析了九名患者的结肠活检和粪便样本。目的是实施测序技术和生物信息学分析工具。
这是一个旨在更广泛的项目的第一项研究。本次中试获得的数据将作为Colonbiome项目分析方法设计的依据。这个更广泛的项目旨在寻找可用于结肠癌早期检测的微生物群标记。为此,将从健康患者和处于结直肠癌不同阶段的患者中收集结肠活检和粪便样本。然后微生物群基因组将被测序以识别组间差异。
人人可用的数据
在这项试点研究中获得的所有数据都已输入欧洲核苷酸档案馆,这是一个公共和协作数据库,所有类型的基因组序列都在该数据库中共享,以造福于整个科学界。此外,第一次试点测试的所有结果都已发表在科学数据期刊上,该期刊也是一份公共期刊,其中详细介绍了序列和使用的生物信息学分析方法。
这项研究不仅旨在对小组未来的工作有所帮助,而且还旨在对所有正在进行类似分析或尝试新的生物信息学工具的研究小组有所帮助,他们可以公开访问本研究中获得的所有结果学习。此外,研究人员保证,他们还将公开后续研究的所有细节,继续为该领域的合作和进步做出贡献。
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